游戏业界是一个与现实相异的奇妙世界，存在着四个由守护女神统治的国家：Planeptune、Lastation、Lowee与Leanbox。四个国家为了争夺女神力量之源“Share”而展开了长期的霸权战争。然而，因某次事件引发的变故，使得四位女神之间的关系与世界格局迎来了全新的转折。在平息了零次元事件的危机后，游戏业界本应步入平稳的过渡期，但关于四位女神的不利谣言却在下界与神界间日益蔓延。为了冲淡这些负面传闻，涅普缇努决定召集另外三位女神，在Planeptune举办一场盛大的庆典。庆典进行得非常成功，在最后一天的比武决赛上，四位女神准备亲自下场一较高下。就在此时，四个自称“The Gold Third”的神秘人物突然闯入会场，向女神们发起了挑战。女神们毫不犹豫地应战，却意外地遭到对方一招秒杀而惨败。被击败的女神们纷纷倒下，画面随之转入一间神秘房间，一个巨大的机动装甲与另一个神秘女声正冷冷地讨论着这个世界即将迎来的“新秩序”。当涅普缇努从昏迷中醒来时，震惊地发现远方赫然拔地而起四座神秘高塔。在确认其他女神皆相安无事后，众人决定各自回到领地，探查这股颠覆世界的新势力究竟为何物，一段充满未知与危机的全新冒险就此展开。